Application of DNA Microarray Technology for Wastewater Analysis
Deoxyribonucleic acid (DNA) microarrays are widely used for differential expression studies and for detection of virulence genes in pure bacterial cultures. Their use in complex microbial samples, such as soil and wastewater, has been relatively less studied. This report presents the results of a... Lue lisää
Deoxyribonucleic acid (DNA) microarrays are widely used for differential expression studies and for detection of virulence genes in pure bacterial cultures. Their use in complex microbial samples, such as soil and wastewater, has been relatively less studied. This report presents the results of a... Lue lisää
-
Tuotekuvaus
Deoxyribonucleic acid (DNA) microarrays are widely used for differential expression studies and for detection of virulence genes in pure bacterial cultures. Their use in complex microbial samples, such as soil and wastewater, has been relatively less studied. This report presents the results of a systematic effort to apply DNA microarrays to pathogen detection and to bacterial source tracking (BST) in wastewater. Parameters such as the method of DNA extraction from the samples, the type of immobilized probe (whether polymerase chain reaction [PCR] amplicons or oligonucleotides), the length and method of immobilization of oligonucleotides, the method of DNA labelling, the combination of PCR amplification with microarray hybridization and the choice of PCR targets have been optimized. Results indicate that the combination of PCR followed by microarray hybridization can detect pathogens in wastewater samples down to a 0.1% detection limit. The use of microarrays for bacterial source tracking gave promising results on human samples, however the probes used in this study only provided signals for general indicators of fecal contamination when used on samples of animal origin. The overall conclusion is that microarray technology has not yet reached the stage of routine use for microbiological analysis of wastewater. This report demonstrates: That the hybridization of total genomic DNA on microarrays has a high detection limit, of the order of 10^7 genomes; That the use of long oligonucleotides or PCR amplicons from 16S rDNA, or cpn60 probes has insufficient specificity to differentiate several important pathogens, especially within the Enterobacteriaceae family; That the use of short oligonucleotide immobilized probes coupled with PCR amplification of conserved genes, such as 16S rDNA, cpn60, or wecE, can detect pathogens in wastewater down to a 0.1% (DNA weight/weight) concentration; and The potential of DNA microarrays in BST, even if further research work remains necessary to achieve this goal. -
Tuotetiedot
- Kustantaja / Valmistaja IWA Publishing
- ISBN 9781843397274
- Tuotekoodi 9781843397274
- Kirjoittajat C. Maynard; F. Berthiaume; J. Harel; K. Lemarchand; L. Masson; P. Bayardelle; Pierre Payment; R. Brousseau
- Sarja WERF Research Report Series
- Kieli Englanti
- Thema-luokitus Teknologia: yleiset näkökohdat
- Ilmestymispäivä 30.09.2004
- Vuosi 2004
- Tuoteryhmä Ulk tiede, luonto
- Tuotepääryhmä Ulkomaiset tietokirjat
- Tuotelinja Kirjat
- Sivumäärä 102
- Pituus (mm) 280
- Leveys (mm) 211
- Korkeus (mm) 11
- Paino (g) 304
- Tuotemuoto Pehmeäkantinen
- ALV 13,5%
Tämä tuote kuuluu tuoteryhmiin
Tuotearvostelut Suomalainen.comissa
Tutustu tuotearvostelujen käytäntöihin ja ehtoihin ennen kuin jätät arvostelun.
Suomalainen.com -verkkokaupassa on mahdollista jättää tuotearvosteluja siellä myynnissä olevista tuotteista. Tuotearvosteluja voivat jättää sekä tuotetta Suomalaisesta Kirjakaupasta ostaneet asiakkaat että muut sivuston käyttäjät. Arvostelijan nimimerkin jälkeinen teksti kertoo, onko kyseessä vahvistettu ostaja vai muu asiakas/sivuston käyttäjä.
-
Vahvistettu ostaja - Kyseinen arvostelu on jätetty käyttämällä tuotteen ostajalle lähetettyä sähköpostilinkkiä. Kyseessä on siis vahvistettu ostaja eli arvostelun jättänyt henkilö on ostanut todennetusti kyseisen tuotteen.
-
Vahvistettu suosittelija - Kyseinen arvostelu on jätetty suomalainen.com -verkkosivustolla. Arvostelijan sähköpostiosoite on vahvistettu, jotta on voitu varmistua siitä, että arvostelun on jättänyt oikea henkilö. Suomalainen.com ei kuitenkaan ole vahvistanut, että kyseinen henkilö on ostanut tuotteen.
- Ei tekstiä nimimerkin jälkeen - Kyseinen arvostelu on jätetty suomalainen.com -verkkosivustolla, mutta arvostelun jättäjän sähköpostiosoitetta ei ole vahvistettu.
Tuotearvostelussa pakollisia tietoja ovat tuotteen pistemäärä (tähdet), otsikko sekä arvosteluteksti. Jos jätät arvostelun sinulle lähetetyn sähköpostilinkin kautta, arvostelu julkaistaan käyttämällä etunimeäsi sekä sukunimen ensimmäistä kirjainta.
Jos jätät arvostelun sivustollamme, voit käyttää arvostelussa myös nimimerkkiä. Arvostelun jättämisen yhteydessä sinulta kysytään sähköpostiosoitetta, jonka avulla vahvistamme, että arvostelun on lähettänyt oikea henkilö, eikä esimerkiksi robotti. Tuotearvostelujen palveluntarjoajana toimii Yotpo. Katso Yotpon tietosuojaseloste.
Arvostelut julkaistaan tuotteen kohdalla automaattisesti ja ne tulevat esiin viiveellä. Suomalainen.com pidättää kuitenkin oikeuden poistaa kommentit, jotka sisältävät epäasiallista, herjaavaa tai halventavaa kieltä, vihapuhetta tai ovat muuten hyvän tavan vastaisia, tai joissa markkinoidaan muiden toimijoiden sivustoja tai tuotteita.
Jättämällä arvostelun annat Suomalaiselle Kirjakaupalle oikeuden käyttää kyseisiä arvosteluja omassa markkinoinnissaan (sekä painettu että digitaalinen) ilman erillistä korvausta. Arvosteluja käytetään myös analysointiin ja markkinoinnin kehittämiseen.
Tuotearvostelun jättäneiden kesken arvotaan säännöllisin väliajoin tuotepalkintoja. Tutustu arvonnan sääntöihin täällä.
Mikäli haluat poistaa jättämäsi tuotearvostelun verkkokaupastamme, pyyntö tästä tulee ohjata asiakaspalveluumme: asiakaspalvelu@suomalainen.com.
Tuotearvostelut eivät ole tarkoitettu asiakasreklamaatioiden tai tilauskyselyjen tekemiseen. Reklamaatiotapauksissa pyydämme ottamaan yhteyttä asiakaspalveluumme: asiakaspalvelu@suomalainen.com.
Jättämällä arvostelun suomalainen.com -verkkokauppaan hyväksyt yllämainitut käytännöt ja ehdot.
Lue lisää tuotearvosteluista.
